Profil
Profile
Ingénieur informatique et développeur full-stack spécialiste du web, avec une forte expérience en gestion de projet recherche et développement, je suis expert en ingénierie logicielle : de la programmation, aux bases de données en passant par l'intelligence artificielle. Mes compétences et mon expérience couvent les domaines de data-science, d'optimisation, du e-commerce, groth hacking, machine learning, ou encore sécurité informatique.
Informatics Engineer and Full-stack developper specialized in web techniques, with a strong background in R & D project management, I am competent in IT development, databases administration, or Artificial Intelligence. My skills and experience cover multiple domains as data-scientist, optimization, e-commerce, groth hacking or IT security.
Formation
Education
Ingénieur ENISE École Nationale d'Ingénieurs de Saint-Étienne
Ingénieur (BAC+5) - spécialité Génie Sensoriel, 2009
Master M2 Informatique Université Jean Monnet, Saint-Étienne
Master 2 (BAC+5), spécialité Web Intelligence, 2014
Master M2 Systèmes d'Information Université Jean Monnet, Saint-Étienne
Master 2 (BAC+5), spécialité SIG (Système d'Information Géographique), 2009
TOEIC
Anglais courant (TOEIC Or : 955 pts sur 990)
Generalist Engineer (Master of Science) National Engineering School of Saint-Étienne
Master's Degree - speciality sensorial engineering, 2009
Master of Science in Informatics University of Saint-Étienne
Master's Degree - speciality Web Intelligency, 2014
Master of Science in Information Systems University of Saint-Étienne
Master's Degree - speciality GIS (Geographic Information Systems), 2009
TOEIC
Fluent english (TOEIC Gold : 955 out of 990 pts)
Expériences professionnelles
Work experience
Webmaster développeur Juillet 2004 - aujourd'hui
[ Internet ] - Auto-Entrepreneur
Création, développement, référencement & SEO et maintenance d'applications web et de sites internet professionnels, personnels, associatifs ou commerciaux.
PHP (Raw/Prestashop/Wordpress/Drupal/Joomla), Javascript (jQuery/vueJS), OVH, Debian, Apache, Google Analytics/Ads/Adsense
Webmaster & developer since July 2004
[ Internet ] - Full-stack Freelance Developer
Creation, development, SEO and maintenance for personal, professional or business websites and web applications.
PHP (Raw/Prestashop/Wordpress/Drupal/Joomla), Javascript (jQuery/vueJS), MySQL/MariaDB, OVH, Debian, Apache, Google Analytics/Ads/Adsense
Chef de Projet SI Janvier 2015 - Avril 2019
Mars 2016 - Avril 2019[ Systèmes d'information ] - Eovi-Mcd Mutuelle, Saint-Étienne
Développement et déploiement de projets pour l'intranet et l'extranet, coordination avec les équipes au sein de la DSI (Direction des systèmes d'information) et de la MOA (Maîtrise d'ouvrage), études de faisabilité, management de prestataires, mesures cout/qualité/délai et intégration de progiciels.
Java (SpringBoot), PHP (Raw/Symphony/EZPublish), Javascript (vueJS/jQuery), Oracle, ElasticSearch, Talend, Tomcat
Janvier 2015 - Janvier 2016[ Systèmes d'information ] - CHU Saint-Étienne
Gestion de projet sur l'optimisation des recettes de l'hopital, le PMSI (Programme de Médicalisation des Systèmes d'Information) et le SIH (Système d'Information Hospitalier), participation à des conférences, réunions avec la DSI (Direction des systèmes d'information), rédaction d'appel à projets, rédaction d'articles et management d'équipe.
PHP, jQuery, SQL Server, MySQL
Project Manager January 2015 - April 2019
March 2016 - April 2019[ Information Systems Division (ISD) ] - Eovi-Mcd Mutuelle, Saint-Étienne
Development and deployment of web projects (intranet/extranet), coordination with teams within the ISD, provider management, software integration in a mutual insurance company.
Java (SpringBoot), PHP (Raw/Symphony/EZPublish), Javascript (vueJS/jQuery), Oracle, ElasticSearch, Talend, Tomcat
January 2015 - January 2016[ Medical informatics ] - Faculty of Medecine, University of Saint-Étienne
Project management on maximizing revenue from hospital, call for projects, article writing and team management.
PHP Raw, jQuery, SQL Server, MySQL
Chargé de recherche Mai 2014 - Décembre 2014
Mai 2014 - Décembre 2014[ Modélisation Informatique ] - SSPIM, Faculté de Médecine, Université de Saint-Étienne
Développement et évaluation du MIMPS (modèle minimum d'information pour la sécurité des patients) et participation à des réunions internationales en tant qu'expert OMS (Organisation Mondiale de la santé).
PHP, jQuery, MySQL, Protégé, Excel, Word, Powerpoint
Ingénieur de recherche Février 2010 - Avril 2014
Janvier 2013 - Avril 2014[ Informatique médicale ] - INSERM, Paris et CHU Saint-Étienne
Développement d'une ontologie des effets indésirables et mise en place d'outils de recherche d'informations sémantiques, de détection du signal pour la pharmacovigilance. Réponses aux appels d'offre de projets de recherche.
PHP, MySQL, Sage, Mathematica, R, Excel, Word, Powerpoint
Aout 2012 - Décembre 2012[ Modélisation Informatique ] - SSPIM, Université de Saint-Étienne
Conception, en coopération avec l'OMS, d'un modèle international pour la sécurité des patients et développement divers d'outils d'informatique médicale. Participation en tant qu'expert OMS à des meetings internationaux.
PHP, MySQL, Protégé, LaTeX
Aout 2010 - Juillet 2012[ Informatique médicale ] - INSERM, Paris
Développement informatique et mise en place d'outils destinés à la fouille de texte ou à la détection du signal pour la pharmacovigilance, création de bases de données, développements divers d'outils d'ingénierie des connaissances. Rédaction d'articles et participation à des congrès d'informatique médicale.
PHP, MySQL, Sage, Mathematica, R, Drools, Excel, Word, Powerpoint
Février 2010 - Juillet 2010[ Informatique médicale ] - SSPIM, Université de Saint-Étienne
Création d'une ontologie de la sécurité des patients à l'hopital pour l'OMS et développement d'outils d'aide au codage médical.
PHP, Protégé, Powerpoint
Février 2009 - Septembre 2009[ Système d'Information Géographique (SIG) ] - CRENAM, Saint-Étienne et IGN, Paris
(Stage de fin d'études d'ingénieur) Recherche et développement sur la perception des couleurs en SIG et utilisation d'outils informatiques basés sur la fouille de données (data-mining).
Java, PostGreSQL, ArcGIS, Word, Eclipse, Windows
Septembre 2008 - Février 2009[ Analyse sensorielle ] - DIPI, Saint-Étienne
(Stage de 4ème année cursus d'ingénieur) Développement de protocoles d'analyse sensorielle. Création et mise en œuvre d'un logiciel pour les évaluations de vision et de toucher (haptique).
PHP, MySQL, Sage, LaTeX, Word, NetBeans, Windows
Septembre 2007 - Février 2008[ Mécanique des Fluides ] - CETHIL, Lyon
(Stage de 3ème année cursus d'ingénieur) Développement d'un logiciel de modélisation de bâtiments en 3D grâce à la géométrie de construction de solide (union, intersection, soustraction).
C++, OpenGL, 3D, Unix, CodeBlocks
Research Engineer February 2010 - December 2014
May 2014 - December 2014[ Medical informatics ] - Faculty of Medecine, University of Saint-Étienne
Development and Evaluation of the MIMPS (Minimum Information Model for Patient Safety) for the WHO (World Health Organization), Genova.
PHP (Raw), Javascript (jQuery), MySQL, Protégé, Excel, Word, Powerpoint
January 2013 - April 2014[ Medical informatics ] - INSERM, Paris and University of Saint-Étienne, France
R&D: IT development and set up of several tools for information retrieval, text mining, database administration, language processing techniques. Scientific paper writing and participation in medical informatics conferences.
PHP (Raw), MySQL, Sage, Mathematica, R, Excel, Word, Powerpoint
August 2012 - December 2012[ Medical informatics ] - SSPIM, University of Saint-Étienne
IT development in knowledge engineering, databases administration, statistical data analysis and programming of help coding and text-processing tools.
PHP, MySQL, Protégé, LaTeX
August 2010 - July 2012[ Informatique médicale ] - INSERM, Paris
R&D: IT development and set up of several tools for information retrieval,and signal detection in pharmacovigilance, database administration.
PHP, MySQL, Sage, Mathematica, R, Drools, Excel, Word, Powerpoint
February 2010 - July 2010[ Informatique médicale ] - SSPIM, Université de Saint-Étienne
Ontology development of a patient safety model for WHO and development of tools to help medical coding.
PHP, Protégé, Powerpoint
Compétences
Skills
Langues :
Languages:
- Anglais+++, Italien++, Espagnol+
- French+++, English+++, Italian++, Spanish+
Informatique :
Computer skills:
- Windows+++, Linux/Unix++
- Internet+++, Réseaux++, Matériel++
- Bureautique Office: Microsoft Office (Word, Excel, Powerpoint, Access, Publisher)+++, OpenOffice/LibrOffice (Writer, Calc, Impress, Base)+++, Google Drive++, LaTeX+
- Virtualisation Virtualization: VirtualBox++, VmWare+
- Système d'information géographique Geographic Information System: ArcGIS++, MapInfo++, Google Earth++
- Conception 3D : Catia+++, SolidWorks++, AutoCAD++
- Mathématiques Mathematics: Mathematica+++, R+, Matlab+, Maple++
- Modélisation Ontologique Ontology development: Protégé++, OWL (format)+
- Moteurs de règles Rule-based system: Drools+, RuleML (format)+
- Moteur de Recherche Search Engine: ElasticSearch++, Lucene+
- Graphismes Graphic & Design: Photoshop++, Paint Shop Pro++, Inkscape+, Gimp+
Programmation/Développement :
IT Development:
- PHP+++, HTML+++, JavaScript+++, jQuery+++, CSS+++, Bootstrap++, VueJS++, APIs (REST/SOAP)++
- Java+++, C++++, OpenGL+, Visual Basic+, Python++, AutoIt++
- Base de données Databases: MySQL+++, Access++, SQLServer++, PostGreSQL++, Oracle++
- Serveur Web Web server: Apache+++, nginx+
- Interface de développement IDE: Visual Studio Code++, Eclipse++, PHPStorm++
- Intelligence Artificielle Artificial Intelligence: Machine Learning+, TensorFlow+
Internet :
- CMS (Wordpress++, Prestashop++, Drupal+, Joomla+, FluxBB/PunBB+++, EZPublish+, PhpBB+, ...)
- Google & APIs+++ : Analytics+++, Ads++, Adsense+++, Search Console (Webmaster Tools)+++
- Sites & Apps: YouTube+++, eBay+++, LeBonCoin+++, Wikipedia+++, PayPal+++, Slack+, Discord+, etc.
Publications
Articles de revues scientifiques
Papers in scientific journals
[ Informatique médicale ]
[ Medical informatics ]
- Souvignet J., Declerck G., Trombert-Paviot B., Asfari H., Jaulent M-C., Bousquet C. - Semantic Queries Expedite MedDRA Terms Selection Thanks to a Dedicated User Interface: A Pilot Study on Five Medical Conditions, Frontiers in Pharmacology, 2019
- Lardon J., Bellet F., Aboukhamis R., Asfari H., Souvignet J., Jaulent M-C., Beyens M-N., Lillo-LeLouët A., Bousquet C. - Evaluating Twitter as a complementary data source for pharmacovigilance, Expert Opinion on Drug Safety, 2018
- Bousquet C., Dahamna B., Guillemin-Lanne S., Darmoni S., Faviez C., Huot C., Katsahian S., Leroux V., Pereira S., Richard C., Schück S., Souvignet J., Lillo-Le Louët A., Texier N. - The Adverse Drug Reactions from Patient Reports in Social Media Project: Five Major Challenges to Overcome to Operationalize Analysis and Efficiently Support Pharmacovigilance Process, JMIR research protocols, 2017
- Souvignet J., Asfari H., Del Tedesco E, Declerck G, Bousquet C. - MedDRA automated term groupings using OntoADR: evaluation with upper gastrointestinal bleedings., Expert Opinion on Drug Safety, 2016
- Asfari H., Souvignet J., Lillo-Le Louët A., Trombert-Paviot B., Jaulent M-C., Bousquet C. - Automated grouping of terms associated to cardiac valve fibrosis in MedDRA, Therapie, 2016
- Lardon J., Abdellaoui R, Bellet F., Asfari H., Souvignet J., Texier N., Jaulent M-C., Bayens M-N., Burgun A., Bousquet C. - Adverse Drug Reaction Identification and Extraction in Social Media: A Scoping Review, Journal of Medical Internet Research, 2015
- Bousquet C., Sadou E., Souvignet J., Jaulent M-C., Declerck G. - Formalizing Meddra to Support Semantic Reasoning on Adverse Drug Reaction Terms, Journal of Biomedical Informatics, 2014
- Souvignet J., Declerck G., Jaulent M-C., Bousquet C. - Evaluation of Automated Term Groupings for Detecting Upper Gastrointestinal Bleeding Signals for Drugs, Drug Safety 2012; 35 (12): 1195-6
- Bousquet C., Garcelon N, Le Beller C., Wiss-Thébault M., Amardeilh F., Souvignet J., Burgun A., Lillo-Le Louët A. - Building a Database of Articles from PubMed for Documentation of Adverse Drug Reactions Related to Antiretroviral Drugs, Drug Safety 2012; 35 (12): 1198-9
Articles et communication orale pour des congrés scientifiques
Papers and oral communication for scientific congress
[ Informatique médicale ]
[ Medical informatics ]
- Rodrigues J-M., Dhingra-Kumar N., Schulz S., Souvignet J. - A Patient Safety Information Model for Interoperability, MIE 2016
- Souvignet J. Asfari H., Lardon J., Spiga R. and Rodrigues J-M. - Toward a Patient Safety Upper Level Ontology, MIE 2015
- Rodrigues J-M. and Souvignet J. - Integrated care: an Information Model for Patient Safety and Vigilance Reporting Systems, MIE 2015
- Lardon J., Asfari H., Souvignet J. Trombert-Paviot B. and Bousquet C. - Improvement of Diagnosis Coding by Analysing EHR and Using Rule Engine: Application to the Chronic Kidney Disease, MIE 2015
- Souvignet J. and Rodrigues J-M. - Integrated Care: a Common Tool for Quality Management and Vigilance, PCSI 2014
- Souvignet J., Asfari H., Declerck G., Lardon J., Trombert-Paviot B., Jaulent M-C. and Bousquet C. - Ci4SeR - Curation Interface for Semantic Resources - Evaluation with Adverse Drug Reactions, MIE 2014
- Declerck G., Souvignet J., Rodrigues J-M. and Jaulent M-C. - Automatic annotation of ICD-to-MedDRA mappings with SKOS predicates, MIE 2014
- Souvignet J., Bousquet C., Trombert-Paviot B., Rodrigues J-M. - Standardization of Patient Safety Reports Comparison by an International Information Model align with Upper Level Ontologies, CKSE 2013
- Souvignet J., Akiyama M., Rodrigues J-M., Fujita K., Bousquet C., Jin Y. and Lewalle P. - Standardisation d'un modèle international d'information pour la comparaison des déclarations des évènements indésirables, SIG IMIA Francophone 2013
- Souvignet J., Declerck G., Trombert-Paviot B., Rodrigues J-M., Jaulent M-C., Bousquet C. - Evaluation of automated term groupings for detecting anaphylactic shock signals for drugs, AMIA Annu Symp Proc. 2012; 882-90
- Souvignet J., Bousquet C., Trombert-Paviot B., Rodrigues J-M. - Ontology Disambiguation in Healthcare Terminologies, PCSI 2012
- Bousquet C., Declerck G., Souvignet J., Jaulent M-C., Rodrigues J-M. - Method for grouping MedDRA terms related to the same medical condition, PCSI 2012
- Bousquet C., Souvignet J., Merabti T., Sadou E., Trombert-Paviot B., Rodrigues J-M. - Method for mapping the French CCAM terminology to the UMLS metathesaurus, Stud Health Technol Inform. 2012; 180:164-8
- Rodrigues J-M., Schulz S., Bousquet C., Souvignet J. - The CEN ISO Standard Categorial Structure as a Top-Level Set of Constraints for Ontology Disambiguation, ICBO 2012
- Souvignet J., Bousquet C., Lewalle P., Trombert-Paviot B., Rodrigues J-M. - Modeling Patient Safety Incidents Knowledge with the Categorial Structure Method, AMIA Annu Symp Proc. 2011; 1300-8
- Bousquet C., Trombert-Paviot B., Souvignet J., Sadou E., Rodrigues J-M. - Evaluation of the CCAM Hierarchy and Semi Structured Code for Retrieving Relevant Procedures in a Hospital Case Mix Database, AMIA Annu Symp Proc. 2010; 61-5
- Bousquet C., Trombert-Paviot B., Souvignet J., Rodrigues J-M. - Evaluation of the French procedures classification for Medico-Economic Evaluation of Endoscopic Activities in a Hospital, PCSI 2010
[ Systèmes d'Information Géographique ]
[ Geographic Information System ]
- Souvignet J., Chesneau E. - Evaluation automatique des relations sémantiques dans une carte à partir des couleurs de la légende, SAGEO 2009
Workshop pour des congrés scientifiques
Workshop for scientific congress
[ Informatique médicale ]
[ Medical informatics ]
- Koutkias V., Souvignet J., Bousquet C., Yuksel M., Prokosch H-U. and Jaulent M-C. - Leveraging Pharmacovigilance through Knowledge Engineering. MIE 2015
- Rodrigues J-M., Larizgoitia I., Akiyama M., Souvignet J., Hansen J. and Schulz S. - International Information Model for Patient Safety (2IMPS): Enhancing care, patient safety and outcome. MEDINFO 2013
Posters pour des congrés scientifiques
Posters for scientific congress
[ Informatique médicale ]
[ Medical informatics ]
- Souvignet J., Le Hello C., Trombert-Paviot B., Brouard B., Chieh A., Boissier C. - Fetching Connected Pedometer Data to Analyze Patients Walking, STC 2016
- Le Hello C., Brouard B., Trombert-Paviot B., Chieh A., Souvignet J., Boissier C. - Utilisation d'un podomètre connecté dans le ré-entraînement à la marche des patients porteurs d'une artériopathie des membres inférieurs , SFT 2015
- Aljunid S-M., Rodrigues J-M., Best L., Mustaffa H-R., Aljunid S-M-H, Trombert-Paviot B., Souvignet J. and Kim S. - ICHI Categorial Structure: a WHO-FIC Tool for Semantic Interoperability of Procedures Classifications, MEDINFO 2015
- Rodrigues J-M., Schulz S. and Souvignet J. - Information Models Terminology and Ontology: a Toolbox for different use cases, MIE 2014
- Asfari H., Souvignet J., Guy C. and Bousquet C. - Knowledge-based method for automated generation of new MedDRA Grouping for bullous conditions, P2T 2014
- Bousquet C., Declerck G., Souvignet J. and Jaulent M-C. - Knowledge-based method for automated generation of MedDRA Groupings, ISOP 2013
- Bousquet C., Souvignet J., and Bayens M-N. - Bayesian measures of signal detection with Dabigatran in the FDA database, ISOP 2013
- Souvignet J., Bousquet C., Corcho O., Trombert-Paviot B., Rodrigues J-M. - From the categorial structure to the content model ICPS, WHOFIC Network Meeting 2010
Réalisations & Portfolio
Creations & Portfolio
Sites Internet
Web sites
Logiciels & Applications Web
Web apps
Récompences
Nominations and Awards
- Lauréat des Olympiades Académiques de Mathématiques, 2007
- Laureate of the French Mathematics Olympiad, 2007
- Vainqueur du 4ème Championnat de France par équipes de Team Fortress 2, 2008
- Winner of the 4th French Championship of Team Fortress 2, 2008
- Deuxième place au concours des "24h du SIG", Paris, 2009
- Second place in the "24 hours of GIS", Paris, 2009
- Premier prix (ex-aequo) de la chasse au trésor mathématique du CIJM, 2009
- Prize Winner (ex-aequo) of the mathematical treasure hunt of CIJM, 2009
- Nomination dans les 100 meilleurs sites "Internet et la Science", Sciences et Avenir n°764, 2010
- Nomination in the 100 best sites "Internet and Science", Sciences et Avenir n°764, 2010
- Nomination au prix du meilleur article original écrit par un jeune chercheur - MIE, Madrid, 2015
- Nomination for the best original paper by a young researcher - MIE, Madrid, 2015
- Nomination au prix du meilleur poster - STC, Paris, 2016
- Nomination for the best poster - STC, Paris, 2016
- Lauréat du challenge Innov'action Eovi-Mcd, 2017
- Laureate of Innov'action challenge Eovi-Mcd, 2017
- Lauréat de la chasse au trésor en ligne "Maths en Scène", catégorie Amateurs, 2021
- Laureate of the online treasure hunt "Maths en Scène", category Amateurs, 2021